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NGS再受NCCN指南认可:肠癌指南更新之基因检测

发布时间:2019-04-11 22:13:55 来源:基因谷 作者:基因谷
NGS(Next-Generation Sequencing)即二代测序技术,又称高通量测序技术,以能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志。近年来,NGS在临床肿瘤学中的应用不断拓宽。结合ctDNA(Circulating Tumor DNA,循环肿瘤DNA),NGS逐渐成为临床开展早筛早诊、分子分型、预后预测、疗效监测、复发监测等研究的强力工具。

 NGS再受NCCN指南认可

肠癌指南更新之基因检测

自2019年第1版的NCCN结肠癌和直肠癌指南发布以来已有不少文章跟踪报道为临床总结指南更新要点作为肿瘤液体活检从业者笔者发现这些报道未能覆盖到基因检测尤其是二代测序在指南中的更新情况特撰写此文作为先前报道的补充

NGSNext-Generation Sequencing即二代测序技术又称高通量测序技术以能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志近年来NGS在临床肿瘤学中的应用不断拓宽结合ctDNACirculating Tumor DNA,循环肿瘤DNANGS逐渐成为临床开展早筛早诊分子分型预后预测疗效监测复发监测等研究的强力工具

以下将为大家呈现4点与基因检测相关的2019年第1版的NCCN肠癌指南更新

01

指南首次明确认可使用NGS技术检测KNB三基因

翻译中文所有转移性结直肠癌患者均应进行RASKRAS和NRAS和BRAF突变的基因分型可以单独检测也可以作为一个NGS panel的一部分进行检测

指南原文All patients with metastatic colorectal cancer should have tumor tissue genotyped for RAS(KRAS and NRAS) and BRAF mutations individually or as part of a next-generation sequencing(NGS) panel.

▼ 指南原文

在上一版的指南当中并未明文提及可使用NGS技术检测KNB三基因这是第一次指南的进一步肯定印证了NGS在结直肠癌临床诊疗中的广泛应用一定程度上代表了NGS的运用是未来的趋势

虽然这是第一次明确肯定使用NGS检测KNB三基因却不是第一次明确肯定在肠癌诊疗中使用NGS技术在上一版的指南中即认可使用NGS检测MSI

▼ 指南原文

翻译中文MSI检测可通过经验证的NGS panel完成特别是对于需要进行RAS和BRAF基因分型的转移性疾病患者

指南原文Testing for MSI may be accomplished with a validated NGS panel, especially in patients with metastatic disease who require genotyping of RAS and BRAF.

如今NGS技术能获得NCCN指南的进一步认可是由于其准确性高能够一次检测大量位点平均成本更低的优势随着对疾病认识的不断深入需要检测的基因会越来越多NGS将成为临床医师越来越重要的诊疗工具

02

NTRK及Larotrectinib进入肠癌指南

翻译中文检测应当包含NTRK基因融合

指南原文Testing should include the neurotrophic receptor tyrosine kinase (NTRK) gene fusion.

▼ 指南原文

Larotrectinib系FDA批准的首个泛实体瘤靶向治疗药物携带NTRK基因融合的不可手术或转移性实体瘤均可使用无需考虑发病部位该疗法于去年11月获批指南中同样给出了该药的建议剂量100mg PO twice daily

然而Larotrectinib难以成为结直肠癌的常规疗法NTRK基因融合在结直肠癌中发生的比例实在太低了只有不到5%

NTRK基因融合在成人和儿童肿瘤中的分布和频率

不同颜色代表不同频率

红点为>90%蓝点为5%至25%绿点为<5%

结直肠癌的标注是一个绿点

Nature Reviews Clinical Oncology volume 15, pages731–747 (2018)

03

EGFR/BRAF/MEK三抑制剂联合疗法进入指南

对于BRAF V600E突变阳性的晚期/转移性患者指南推荐了两套方案在先前接受过奥沙利铂化疗的患者中使用两套方案均为1个EGFR抑制剂+1个BRAF抑制剂+1个MEK抑制剂

▼ 指南原文

方案一BRAF抑制剂Dabrafenib达拉非尼+MEK抑制剂trametinib曲美替尼+EGFR抑制剂cetuximab西妥昔单抗 or或 panitumumab帕尼单抗

该方案基于NCT01750918研究研究纳入经治BRAF突变的晚期结直肠癌患者随机分组三组D+T组D+P组D+T+P组在35例接受三药方案组的患者中最终整体有效率为26%1例患者达到完全缓解疾病控制率为83%有效率方面远高于两药联合的10%ORR也因此成为此类患者可选方案之一

方案二BRAF抑制剂Encorafenib+MEK抑制剂binimetinib+EGFR抑制剂cetuximab西妥昔单抗 or或 panitumumab帕尼单抗

该方案基于III期BEACON CRC研究Encorafenib是BRAF抑制剂binimetinib是MEK抑制剂采用三种药物联合方案治疗30例经治进展的BRAFV600E突变的转移性结直肠癌患者有效率可达到48%其中有3位患者达到完全缓解疾病控制率可达93%中位PFS为8个月中位OS为15.3个月

两个方案中的六个药物在我国目前已获批的药物仅有西妥昔单抗

04

MLH1缺失的BRAF V600E突变患者仍有1%可能为林奇综合征患者

翻译中文绝大部分情况下MLH1缺失下的BRAF V600E突变可排除林奇综合征然而大约1%的同时存在MLH1缺失的BRAF V600E突变属于林奇综合征在BRAF V600E突变的患者中排除具有强家族史的患者进行胚系筛查需谨慎

指南原文The presence of a BRAF V600E mutation in the setting of MLH1 absence would preclude the diagnosis of Lynch syndrome in the vast majority of cases. However, approximately 1% of cancers with BRAF V600E mutations (and loss of MLH-1) are Lynch syndrome. Caution should be exercised in excluding cases with strong family history from germline screening in the case of BRAF V600E mutations.

▼ 指南原文

以往人们认为MLH1缺失和BRAF V600E突变是不会在林奇综合征中同时发生的两个事件MLH1缺失时的BRAF V600E突变必然是散发性结直肠癌然而医学的一大特点就是一切皆有可能在这一版的指南中这个统治指南多年的说法终于进行了自我修改自此BRAF V600E不再是100%排除林奇的指标临床医师在排除时需要更加谨慎结合患者的家族史作出决策

除了以上NGS为临床效力的地方还有更多如NCCN遗传性/家族性肠癌高风险评估指南中列出的相关基因和疾病多达4页使用NGS技术即可对这些基因进行快速全面的检测如结直肠癌中约3-5%的患者为HER2+这些患者有机会从抗HER2治疗中获益如研究表明携带POLE等DDR通路基因突变的患者对免疫治疗响应的机会更高……

多达4页的基因和疾病

NCCN指南2018年第1版遗传性/家族性风险评估指南结直肠癌

我们期待看到NGS在临床越来越广泛的应用更期待与中国的临床医师和科学家开展越来越多的合作为中国患者提供越来越精准的医疗



作者:基因谷
链接:https://xueqiu.com/1912517390/124961099
来源:雪球
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